Helixfold

グリッドを横切る残基のチェーンを曲げて、疎水性ユニットが埋められたコアに集まるようにし、エネルギーを実証済みの最小値まで絞り込みます。

遊び方

タンパク質は、2D 格子上の疎水性 (H) 残基と極性 (P) 残基の鎖としてモデル化されます。結合せずに隣接する疎水性の隣人はエネルギーを低下させます。目標は、H 残基がコンパクトなコアを形成し、最適なエネルギーが得られるように鎖を折りたたむことです。

• 残基をクリックして、その残基を中心にチェーンの尾部を回転させます。
• 同じ残基を交互にクリックして、反対方向にピボットします。
• スピン ボタンを使用して、デフォルトのピボット方向 (時計回り/反時計回り) を反転します。
• パズルに勝つためにチェーンの証明可能な最小エネルギーに達します。

コントロール

• デスクトップ: 残留物をクリックしてピボットし、もう一度クリックして反転し、スピンを切り替え、リセットを使用してまっすぐにします。
• 携帯電話とタブレット: 残留物をタップしてピボットします — 完全にタッチフレンドリーです。

ヒントと戦略

• 形状ではなく、H-H 接触を数えます。最終的に隣接する非結合の疎水性ペアごとにエネルギーが低下します。
• 長い腕ではなく、コンパクトな塊を目指してください。 H 残留物によって露出される表面積はエネルギーの無駄になります。
• フォールドが停止した場合は、リセットして、最初に H 残基の最も密度の高いクラスターからコアをシードしてみます。

学べること

Helixfold は、タンパク質の折り畳みの古典的な疎水性極性格子モデルに基づいて構築されており、折り畳みの探索をパズルに変えます。

• スキル: 生化学、タンパク質フォールディング、HP モデル、最適化
• 最適な対象: 上級高校/大学
• 保護者と教師向け: タンパク質のフォールディングの HP モデル。

ヘリックスフォールドについて

Helixfold は、タンパク質の折り畳みの古典的な疎水性極性格子モデルに基づいて構築されており、最小エネルギー立体構造の探索を触覚パズルに変えます。これは、3 つのチェーンの長さとデイリー モードと練習モードを備えたオリジナルの無料ブラウザ ゲームです。

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