Protein Fold

残基の鎖が与えられ、一部は疎水性 (H) で、一部は疎水性ではありません。それをグリッド上で折り畳むと、疎水性残基が集まって埋められたコアになります。隣接しない H-H ペアが接触することで、構造のエネルギーが低下します。それを解決するには最低のエネルギーに到達します。

• チェーンをグリッド上で曲げて折ります
• 疎水性 (H) 残基をコアにまとめます
• 埋め込まれたすべての H-H 接点により総エネルギーが削減されます
• ターゲットの低エネルギーフォールドをヒットしてレベルをクリアします

• 長いチェーンの場合は簡単、中程度、またはハードの難易度
• 毎日のパズルまたは新しいシーケンスの練習

• デスクトップ: クリックしてドラッグし、チェーンを曲げたり形状を変更したりできます
• 携帯電話とタブレット: チェーンを指でドラッグして折りたたむ

• 長い鎖ではなく、コンパクトなブロブを目指します。接触は残基が並んでいる場合にのみ形成されます。
• H 残基を内側に押し込み、残りを表面に置いておきます
• フォールド方向にコミットする前に、潜在的な H-H ペアをカウントします。

Protein Fold は、タンパク質が疎水性コアの周りでどのように折りたたまれるか、つまりタンパク質に形状を与える原理に基づいて構築された生化学パズルです。

• スキル: タンパク質のフォールディング、生化学、疎水性相互作用、構造と機能
• 最適対象: およそ 9 年生から 12 年生 (14 歳以上)
• 保護者と教師向け: 本物の生化学の概念を空間パズルにしました。

疎水性残基と極性残基の鎖を、疎水性のものが核に埋もれるように折りたたみ、隣接しないH同士の接触ごとに得点するのは、タンパク質の折りたたみのHP格子モデルである。

埋もれた接触を直接採点することが、独自の単純化である。

それは本質的な物理を保った大胆な単純化である。疎水効果、つまり周囲の水のエントロピーを最大化するために非極性基が集合することは、タンパク質を形へと導く主要な力である。そのためほとんど何も含まないモデルでも、それとわかるタンパク質らしい折りたたみを生み出す。

Protein Fold は、疎水性コアタンパク質の折り畳みモデルを中心に構築された生化学パズルです。これは、PlayPendium 用に社内で作成されたオリジナルの無料ブラウザ ゲームです。

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